病情分析：小颌畸形综合征患者可能存在认知功能障碍，但智商是否低下取决于个体差异。
小颌畸形综合征与遗传因素有关，也可能是孕期营养不良导致的，这些因素可能间接影响胎儿大脑发育，从而影响智商。但是，智商受到多种因素的影响，如遗传、环境、教育等，因此，具体智商水平还需通过专业评估确定。
如果患者存在明显的智力下降或其他神经发育异常表现，应考虑是否存在染色体异常或基因突变引起的先天性遗传疾病，需要进一步完善染色体核型分析、基因检测等相关检查以明确诊断。
在关注小颌畸形综合征的同时，应注意患者的智力发展，并定期监测其生长指标。必要时，可咨询专业医生，制定针对性的治疗方案，促进患儿健康成长。