病情分析：

停经46天做彩超还不能确定怀孕，可能是因为受孕时间短、宫外孕、胚胎停育等原因所导致的。

1、受孕时间短

正常情况下，女性怀孕40天左右时，通过彩超检查可以在宫腔内看到孕囊，怀孕46天左右时，孕囊可能还未发育到能看到孕囊的程度，所以进行彩超检查，可能无法确定怀孕的情况。建议患者可以在停经50天左右时再进行彩超检查，此时一般可以看到孕囊。

2、宫外孕

宫外孕是指受精卵在子宫体腔以外的部位着床发育，患者可能会出现阴道出血、腹痛等症状，进行彩超检查可能无法看到孕囊。患者可以通过人绒毛膜测定、妇科彩超等方式明确诊断。如果确诊为宫外孕，患者可以通过手术的方式进行治疗。

3、胚胎停育

胚胎停育是指妊娠早期由于某种原因导致的胎儿停止发育，患者可能会出现阴道流血、腹痛等症状，进行彩超检查可能无法看到孕囊。如果确诊为胚胎停育，建议患者需要及时通过清宫手术等方式进行手术治疗。

除此之外，葡萄胎等疾病也可能会出现这种情况。建议患者及时就医，在医生指导下进行对症治疗，以免延误病情。