病情分析：腘窝囊肿患者应谨慎进行跑步，避免过度活动加重囊肿压迫神经的症状。
腘窝囊肿是由于关节滑膜腔内的液体积聚形成的囊性结构，跑步时膝关节反复屈伸运动可能导致囊内压力增加，刺激囊壁，引起疼痛。因此，对于存在腘窝囊肿的患者，应避免度跑步，以减少对囊肿的刺激和压迫。如果囊肿较大或伴有严重症状，应避免跑步，以免造成损伤。
若腘窝囊肿较小且无明显不适，可以适当进行低强度的慢跑锻炼，但需注意控制运动量，避免长时间持续跑步。
建议定期复查超声检查，监测腘窝囊肿的变化，并遵循医生的建议调整运动方式和强度。