病情分析：甲减可能导致两侧肌肉疼痛，尤其在病情严重或长期未治疗的情况下。
甲减时甲状腺激素分泌不足，影响身体新陈代谢，导致肌肉组织受影响，出现无氧糖酵解增加，进而引发肌肉酸痛。因此，当患者出现两侧肌肉疼痛时，应考虑甲减的可能性，并及时就医进行甲状腺功能检查。
但需要注意的是，如果疼痛伴随发热、乏力等症状，可能是由于感染或其他疾病引起的。此时需要排除其他潜在病因，以免延误诊断和治疗。
建议定期监测甲状腺功能指标，同时注意保持良好的生活习惯，包括均衡饮食、适量运动和充足休息，以预防甲减的发生和发展。