病情分析：婴儿三个月消化不良可以考虑婴儿腹部按摩、婴儿肠道微生物调节剂、益生菌制剂、婴儿消化酶补充剂、中药调理等方法进行治疗。如果症状持续或加重，应尽快就医以获得适当的诊断和治疗。
1.婴儿腹部按摩
通过轻柔地顺时针方向按摩婴儿的肚子来促进肠胃蠕动，改善消化吸收功能。适用于轻微消化不良的情况。
2.婴儿肠道微生物调节剂
通过调整肠道微生态环境，抑制致病菌过度繁殖，缓解由肠道菌群失调引起的消化不良症状。针对非感染性腹泻、腹胀等消化系统紊乱具有一定的效果。
3.益生菌制剂
通过增加有益菌的数量和活性，抑制有害菌的生长，恢复肠道微生态平衡，减轻消化不良的症状。对于因肠道菌群失衡导致的腹泻、便秘等问题有较好的改善作用。
4.婴儿消化酶补充剂
提供外源性消化酶以帮助分解食物，减少未被完全消化的食物在肠道中的滞留时间，从而缓解消化不良症状。用于治疗先天或后天缺乏特定消化酶所导致的乳糖不耐受、脂肪泻等情况。
5.中药调理
利用中药材如山楂、茯苓等，通过健脾消食、理气化湿的作用来改善脾胃运化功能，达到辅助消化的目的。适用于小儿食欲不振、积食等症状。需注意个体差异及可能存在的过敏反应。
家长应注意观察宝宝的喂养情况，调整饮食结构，避免过量摄入难以消化的食物。若经上述处理无效且病情加重，应及时带孩子就医，以免延误病情。