病情分析：

角膜移植手术后眼睛磨着疼，可能是由于排异反应、局部感染、干眼症、圆锥角膜、青光眼等原因引起的。

1、排异反应

角膜移植是指通过手术将健康的角膜植入患者眼内，达到治疗角膜疾病的目的。角膜移植手术后，患者可能会出现排异反应，导致眼睛出现疼痛、异物感、流泪等症状。患者可以遵医嘱使用妥布霉素滴眼液、氯替泼诺滴眼液等药物缓解不适症状。

2、局部感染

角膜移植手术后，如果患者不注意局部卫生，可能会导致细菌侵入，从而引起局部感染的情况。患者可能会出现眼睛疼痛、畏光、流泪等症状。建议患者在医生指导下使用左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等进行滴眼治疗。同时，患者也可以遵医嘱使用生理盐水冲洗眼睛进行治疗。

3、干眼症

如果患者本身患有干眼症，在角膜移植手术后，可能会由于角膜缺损，导致患者出现眼睛干涩、疼痛等不适症状。患者可以遵医嘱使用玻璃酸钠滴眼液、聚乙烯醇滴眼液等药物进行治疗。

4、圆锥角膜

圆锥角膜是指以角膜扩张为特征，角膜中央或旁中央扩张变薄，最终导致视力下降的一种眼病。患者可能会出现视力下降、视物模糊、疼痛等症状。患者可以遵医嘱使用阿托品滴眼液、硝酸毛果芸香碱滴眼液等药物进行治疗。必要时，患者也可以通过角膜移植术进行治疗。

5、青光眼

青光眼是一种以眼压升高、视神经萎缩和视野缺损为特征的疾病。患者可能会出现眼胀、眼痛、视物模糊、流泪等症状。患者可以遵医嘱使用盐酸卡替洛尔滴眼液、盐酸倍他洛尔滴眼液等药物辅助改善。如果药物得不到改善，患者可以通过手术的方式进行治疗，比如小梁切除术、房水引流装置植入术等。

建议患者及时到医院就诊，明确病因后遵医嘱进行治疗。