病情分析：男性阴茎上长水疱应该去医院泌尿外科就诊，医生检查后才能确定是阴茎炎症还是疱疹病毒感染。若为一般炎症，建议用清水洗净，再涂红霉素软膏，口服广谱抗生素，3-5天即可恢复正常。如有性不洁，经化验确诊为疱疹病毒感染，需提高免疫能力，服用抗病毒治疗的药物，可用万祺或阿昔洛韦软膏局部涂抹，可治疗疱疹病毒，一般需要7-14天。