病情分析：

新生儿消化道畸形做手术是否有后遗症，需根据患儿身体素质及术后护理等方面判断。

1、没有

消化道畸形一般是由于先天性发育不良、感染等因素引起。患儿若患有消化道畸形，一般可在医生的指导下进行手术治疗，若患儿身体素质较好，且术后护理得当，一般不会出现后遗症。

2、有

但若患儿身体素质较差，且术后护理不得当，可能会引起胃肠功能紊乱，从而出现腹胀、腹泻等消化不良的症状，严重时还可能会引起胃肠道出血，甚至出现感染的情况，此时则可能会有后遗症。

建议消化道畸形的患儿在术后恢复期，应注意合理饮食，避免食用辛辣、油腻、生冷等刺激性食物，如辣椒、肥肉、雪糕等，以免影响术后恢复。此外，患儿还应注意伤口的护理，避免出现伤口感染的情况，以免影响病情恢复。另外，患儿还应注意定期到医院进行复查，监测病情变化。