病情分析：结膜炎和巩膜炎眼睛充血的区别在于病因、症状、病程、治疗方式和预后。
1.病因
结膜炎通常由病毒、细菌感染引起，而巩膜炎则多为免疫反应或遗传因素导致。因此，前者主要针对特定致病源进行抗感染治疗，后者需要调整治体免疫状态。
2.症状
结膜炎常表现为眼红、分泌物增多、瘙痒等症状，且症状一般局限于结膜组织；巩膜炎的症状包括眼痛、畏光、视力减退等，并可能伴随眼部肿胀。此外，巩膜炎还可能出现头痛、面部疼痛等非眼科典型症状。
3.病程
结膜炎的病程较短，多数患者可在数日内痊愈；而巩膜炎的病程较长，可持续数周至数月不等。
4.治疗方式
结膜炎的治疗主要包括使用抗生素或抗病毒药物以消除感染，如左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液、更昔洛韦眼膏等；而巩膜炎的治疗需考虑免疫调节，常用免疫抑制剂有环磷酰胺、甲氨蝶呤等口服药，以及环孢素A、他克莫司等局部用药。
5.预后
结膜炎的预后较好，及时治疗可有效控制病情发展；巩膜炎的预后取决于其类型及是否伴有全身性疾病，部分类型的巩膜炎可通过规范治疗得到缓解，但复发率较高。
在诊断结膜炎与巩膜炎时，应通过裂隙灯显微镜检查来区分两种疾病的不同特征。建议定期复查，监测病情变化，以便及时发现并处理并发症。