病情分析：如果女性在怀孕三个月的时间，在进行病号检查的时候，发现存在卵巢囊肿，这种一般没有什么太大的问题，关键就是看一看这个卵巢囊肿的大小，因为卵巢囊肿直径如果没有超过5厘米的话，一般不会对身体健康和胎儿发育造成明显影响的，但是如果过大就需要在医生的指导下处理。