病情分析：

三个月的宝宝便秘可以通过一般治疗、物理治疗、药物治疗等方式进行缓解，多考虑是饮食不当、肠道菌群失调等原因导致的，但不排除是先天性巨结肠造成的，需要根据引起的原因进行针对性的治疗。

1、饮食不当

如果在平时不注意宝宝的饮食健康，喂养不当，可能会影响胃肠的蠕动，从而出现大便干结的情况。建议可以通过多喝水的方式进行改善，也可以适当吃清淡的食物进行缓解，比如苹果汁、蔬菜汁等。

2、肠道菌群失调

肠道菌群失调可能是胃肠功能紊乱引起的，通常会出现腹胀、腹痛等症状。建议可以在医生的指导下，合理使用双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒等药物进行治疗。

3、先天性巨结肠

先天性巨结肠是由于胚胎发育期间，直肠发育不良引起的，可能会出现排便困难、腹胀等症状。建议及时到正规医院，通过腹腔镜手术进行治疗。

除以上原因外，也有可能是肠梗阻、肠套叠等原因导致的，建议及时就医。