病情分析：

三个月的婴儿消化不良，肚子里有胀气可能是腹部受凉、饮食不当、胃肠道功能紊乱等原因引起的。

1、腹部受凉

如果婴儿腹部受凉，可能会导致胃肠道痉挛，从而出现上述症状。建议家长用温水袋给婴儿热敷腹部，也可以在医生的指导下服用双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒等药物进行治疗。

2、饮食不当

如果婴儿吃了太多食物，可能会导致食物在胃肠道内不能及时消化和吸收，从而出现胀气的情况。建议家长不要一次性给婴儿吃太多食物，可以少食多餐，同时注意婴儿的进食量，避免一次性吃太多，也可以在医生的指导下服用双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒等药物进行治疗。

3、胃肠道功能紊乱

如果婴儿饮食不当、精神压力过大，可能会导致胃肠道功能紊乱，出现消化不良、腹胀、腹泻等症状。建议家长多给婴儿吃一些清淡易消化的食物，也可以在医生的指导下服用枯草杆菌二联活菌颗粒、双歧杆菌三联活菌散等药物进行治疗。

除此之外，也可能是胃肠炎、肠梗阻等原因引起的。如果婴儿的不适症状较为严重，建议家长及时带婴儿到正规医院就医，以免延误病情。