病情分析：颅内段血管彩色多普勒超声和脑CT的区别是两者检查不同。脑CT主要是观察大脑结构，经颅多普勒主要是监测脑血流，脑CT是对大脑的X射线断层扫描，主要利用各种脑组织对X射线的不同吸收的系数。经颅多普勒利用超声波的多普勒效应研究大脑中的血管和血流，检查血流的速度和方向，检查血管是否堵塞或血栓形成。