病情分析：

通常情况下，没有百令胶囊和硒酵母片哪个治疗甲状腺效果好些的说法。百令胶囊和硒酵母片都可以用于治疗甲状腺疾病，患者可以在医生指导下进行选择。

百令胶囊的主要成分是发酵冬虫夏草菌粉，具有补肺肾、益精气的功效，在临床上常用于治疗肺肾两虚引起的咳嗽、气喘、咯血、腰酸背痛、面目浮肿等症状。而硒酵母片的主要成分是硒酵母，具有补硒的功效，在临床上常用于治疗低硒引起的肿瘤、肝病、心脑血管疾病等。因此，百令胶囊和硒酵母片都可以用于治疗肺肾两虚引起的甲状腺疾病。

建议患者需要在医生指导下进行用药治疗，不可以自行盲目用药，以免因用药不当引起不适症状。另外，对于脾胃虚弱的患者，需要避免食用百令胶囊，以免加重病情。