病情分析：硝呋太尔制霉素软胶囊和苦参凝胶可以同时使用。
硝呋太尔制霉素软胶囊对厌氧菌有抗菌活性，而苦参凝胶能够抑制多种球菌及杆菌的生长，从而起到抗感染的作用。
在某些特定情况下，比如存在药物相互作用或患者有过敏史时，应谨慎同时使用这两种药物。
在使用这两种药物时需注意可能出现的副作用，并且建议在医师指导下使用以确保安全有效。