病情分析：小儿菌痢可以使用蒙脱石散、双歧杆菌三联活菌、枯草杆菌二联活菌、布拉氏酵母菌散、盐酸小檗碱等中成药进行治疗。但是，由于菌痢是由志贺菌属引起的肠道传染病，治疗需谨慎，建议在医生指导下使用药物，并及时就医。
1.蒙脱石散
蒙脱石散适用于急、慢性腹泻及消化道炎症。该药物能吸附病原体和毒素，保护胃肠黏膜。服用时需注意剂量控制，婴儿应在医师指导下使用。
2.双歧杆菌三联活菌
双歧杆菌三联活菌用于因肠道菌群失调引起的腹泻、便秘等。此药可直接补充正常生理性细菌，抑制致病菌生长，调整失调的肠道菌群。本品应放置于冰箱冷藏保存，且宜连同包装一起取出后服用。
3.枯草杆菌二联活菌
枯草杆菌二联活菌适用于消化不良、食欲不振等症状。此药内含有益菌群，能够促进营养物质的吸收，调节胃肠道微生态平衡。对于婴幼儿，在使用前应咨询医生并严格按照说明书指导进行。
4.布拉氏酵母菌散
布拉氏酵母菌散可用于急性腹泻病程中出现水样便的情况。此药含有活性微生物，可以定植于肠上皮细胞表面，抑制病原菌过度繁殖，从而起到治疗效果。对本品过敏者禁用，过敏体质者慎用。
5.盐酸小檗碱
盐酸小檗碱主要用于治疗细菌性痢疾以及肠炎等肠道感染性疾病。其具有抗菌的作用，能够对抗金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌等多种革兰氏阳性菌和阴性菌。溶血性贫血患者及葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症患者应禁用。
在使用中成药治疗小儿菌痢的同时，应注意患儿的饮食调理，避免辛辣刺激性食物，以免加重肠胃负担。必要时，可在医师指导下使用抗生素如阿莫西林克拉维酸钾进行抗感染治疗。