病情分析：三个月婴儿枕秃可能是由维生素D缺乏、钙质缺乏、睡眠环境不当、头皮湿疹、头癣等引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。
1.维生素D缺乏
维生素D有助于促进钙和磷的吸收和利用，若婴儿体内缺乏维生素D，则会导致骨骼发育不全、颅骨软化等症状。可通过医生指导使用维生素AD滴剂、维生素D3等药物进行补充。
2.钙质缺乏
钙是构成骨骼的重要元素，缺钙会影响骨骼发育，导致颅骨变薄，从而引起枕秃的现象。可在医师指导下通过服用葡萄糖酸钙口服溶液、碳酸钙D3颗粒等药物进行补钙治疗。
3.睡眠环境不当
睡眠环境不当可能导致宝宝睡眠不安稳，频繁翻身，长期如此可能会对头部造成摩擦，出现枕秃的情况。改善睡眠环境，保持室内通风透气，调整室温至适宜状态，通常可缓解不适症状。
4.头皮湿疹
头皮湿疹是由多种内外因素引起的瘙痒剧烈的一种皮肤炎症反应，如日光照射、接触致敏原等。由于瘙痒，患者会不断搔抓，从而导致头发脱落形成斑片状脱发区。可以遵医嘱使用他克莫司软膏、吡美莫司乳膏等药膏局部涂抹来帮助改善病情。
5.头癣
头癣由真菌感染引起，具有一定的传染性，可通过直接或间接接触传播。典型表现为脱发斑块、鳞屑和头皮炎性反应，严重时可导致永久性脱发。建议家长及时带孩子就医，可以在医生指导下使用酮康唑洗剂、二硫化硒洗剂等药物进行治疗。
日常生活中，应关注孩子的营养均衡，定期进行体检，监测身高、体重增长情况以及是否达到同龄儿童的正常水平。必要时，可咨询儿科医生，评估是否需要进行微量元素检测或生长发育评估。