卵巢性闭经与子宫性闭经在发病机制、卵巢功能状态及临床表现上均存在显著差异，需要仔细鉴别诊断。
从发病机制来看，卵巢性闭经由卵巢本身病变引发，常见于早发性卵巢功能不全或功能性卵巢肿瘤等疾病；而子宫性闭经则源于子宫内膜对卵巢激素反应异常，多与子宫发育不良或器质性病变相关。在卵巢功能方面，前者必然伴随卵巢功能紊乱，后者则可能保留正常卵巢功能。临床表现上，卵巢性闭经患者多表现为月经稀发、经量减少及高雄激素症状如多毛症；子宫性闭经则常合并子宫内膜炎症反应，出现发热、异常阴道分泌物、盆腔疼痛及不规则出血等感染征象。
这两种闭经类型的核心鉴别要点集中在以下两方面：
1. 卵巢性闭经源于卵巢病变伴功能异常，子宫性闭经由子宫内膜异常导致且卵巢功能可能正常
2. 卵巢性闭经以月经紊乱为主症，子宫性闭经多合并感染症状
