小儿肺泡间质综合征的预后取决于个体症状表现及医学检查结果，及时干预可最大限度降低对患儿健康的损害。
该疾病的治疗效果与病情严重程度密切相关。当患儿因细菌或病毒感染导致肺泡组织损伤时，若仅表现为轻微症状（如无显著呼吸急促、面色苍白等），且肺部CT未显示纤维化改变，通常通过头孢类抗生素（如头孢克肟颗粒）或支气管扩张剂（如多索茶碱葡萄糖注射液）即可获得良好疗效。反之，若出现严重干咳、呼吸频率异常增高，特别是伴随CT显示明显肺纤维化及血氧饱和度低于85%时，则需立即进行氧疗并配合糖皮质激素（如注射用甲泼尼龙琥珀酸钠）治疗，此类情况下疾病往往难以完全治愈。
针对该疾病的日常防护需重点关注以下两方面：
1. 避免暴露于工业污染环境，外出时应做好口罩等防护措施
2. 定期进行肺部功能监测，及时发现病情变化
