扁桃体3度肥大的治疗方案需根据病因差异制定，急性炎症与慢性炎症导致的肿大需采取不同干预措施。
对于急性炎症引发的扁桃体持续性水肿，临床首选抗感染治疗，通过鼻腔喷雾或青霉素类抗生素等药物控制感染、缓解症状，多数情况下可避免手术干预。而慢性炎症导致的反复感染则需更积极的处理：当出现抗菌药物治疗无效、伴随分泌性中耳炎或严重气道阻塞（表现为咽部异物感、睡眠呼吸暂停、发音吞咽障碍）时，手术成为必要选择。这类患者检查可见双侧扁桃体显著充血肿大，表面附着脓栓或蜂窝样组织。传统切除术与腺样体刮除术已逐渐被低温等离子射频消融术取代，后者凭借术中出血少、黏膜损伤小、恢复快及复发率低等优势成为主流术式。
儿童扁桃体肥大的管理需重点关注两个维度：
1. 10岁前应定期监测扁桃体大小变化，警惕睡眠打鼾、反复感染等并发症
2. 青春期后扁桃体自然萎缩使发病率下降，但仍需观察生长发育情况
