九价HPV疫苗并不适合所有人群接种，包括已感染HPV者、超出适用年龄者以及处于特殊生理阶段的女性。
九价HPV疫苗作为预防性疫苗，主要针对高危型HPV感染引发的宫颈癌、外阴癌、肛门癌等疾病提供防护。对于已感染HPV的个体，疫苗虽能刺激抗体产生，但无法清除现有感染，因此接种意义有限。就年龄因素而言，9-45岁是疫苗最佳接种窗口期，超龄人群因HPV暴露风险累积可能导致防护效果降低。处于备孕、妊娠、哺乳及经期的女性接种可能影响免疫应答效率，并可能引发不良反应，故建议暂缓接种。
除上述情况外，以下两类人群也需特别注意接种禁忌：
1. 上呼吸道感染期间接种可能加重身体负担
2. 易过敏体质者接种存在超敏反应风险，接种后出现不适需立即就医
