小儿推拿作为传统中医疗法，正确操作可舒经活络、活血化瘀，但若手法不当可能引发皮肤、肌肉或神经损伤等风险。
在实施小儿推拿时需特别注意手法和力度控制。不当的推拿力度可能造成表皮毛细血管破裂，导致局部红肿甚至皮肤破损，此时应立即冰敷并配合抗生素软膏预防感染。更深层的问题可能涉及肌肉组织损伤，表现为推拿部位持续性疼痛和肿胀，需通过非甾体抗炎药物缓解症状。最严重的情况是神经末梢受压引发的传导障碍，若出现肢体麻木或活动受限，应及时采用神经营养药物进行干预。所有操作都应在专业医师指导下完成，避免自行处理。
除上述常见问题外，还需警惕两类严重并发症：
1. 骨骼系统损伤，包括幼儿脆弱骨骼的应力性骨折
2. 胸腔损伤，不当的胸背部推拿可能导致气胸或血肿形成
