牙龈疼痛的诱因复杂多样，可归纳为病理性因素和生理性因素两大类。
当牙龈缘积聚大量菌斑和牙石时，会激活人体免疫系统产生强烈反应。免疫细胞与细菌的对抗过程会引发炎症反应，这是牙龈炎、牙周炎等疾病导致疼痛的主要机制。临床表现为牙龈肿痛，严重时伴发出血症状。这类情况需要通过牙周基础治疗清除致病因素，对于顽固性病例可能需实施牙周翻瓣术等进阶治疗措施。
非疾病因素导致的牙龈疼痛在青春期和妊娠期更为常见，主要涉及以下两个方面：
1. 食物嵌塞和不良修复体会破坏牙周结构，食物残渣滋生细菌并刺激牙龈，引发炎症反应。
2. 激素水平变化会加剧牙龈对刺激的敏感性，特别是在青春期和妊娠期等特殊生理阶段。
