使用复方甲硝唑阴道栓后出现棕色分泌物，主要可能与药物吸收不良、操作不当或宫颈炎症等因素有关，建议根据具体原因采取相应处理措施。
在用药过程中，若栓剂放置位置过浅可能导致药物未完全吸收，残留药物会随阴道分泌物排出。此外，操作时若力度不当可能造成阴道黏膜轻微损伤，引发少量血性分泌物，这种情况通常无需特殊处理但需继续观察。对于存在宫颈炎的患者，炎症刺激会导致黏液脓性分泌物增多并伴有异味、瘙痒等症状，此时需在医生指导下使用抗生素如阿莫西林或多西环素，必要时可配合物理治疗如微波理疗。
出现异常分泌物还需警惕以下两种情况：
1. 药物吸收不良或操作不当引起的分泌物异常，通常调整用药方法即可改善。
2. 宫颈炎等病理性因素需及时就医进行针对性治疗。
