亚临床甲亢通常有外源性因素和内源性因素造成。外源性因素也通常又分为药物因素、精神因素和饮食因素，比如过量服用含碘的药物，有可能会诱发亚临床甲亢。还有可能是情绪不稳定，精神压力大，也会引起亚临床甲亢。也有可能是不良的饮食习惯造成的，比如长时间摄入高碘食物，也会引起亚临床甲亢，常见的食物有海鱼、海带、蔬菜等。内源性因素又分为亚急性甲状腺炎和妊娠等因素。亚急性甲状腺炎也会引起亚临床甲亢，妊娠期间也可能会引起甲亢。