睾丸穿刺和活检的主要区别在于两种检查方法的操作过程是不同的。睾丸活检指的是用各种方法将患者睾丸的一部分组织取出来，送到正规医院的病理科进行染色，然后放到显微镜下，观察睾丸的病变情况，目前主要适用于无精症的检查，是用来诊断睾丸生精功能的金标准。睾丸活检的方法有很多，而睾丸穿刺是睾丸活检术的一种，其他方法还包括睾丸切开活检术，相比之下，睾丸穿刺活检创伤较小，但取出的组织分量较少，容易导致病理检查结果有误差。