孕早期腹痛有褐色分泌物有可能是由于先兆流产或者是胚胎发育异常导致的，这时需要了解是否有明显的诱因。女性在剧烈运动中体力劳动或者性生活之后有褐色的分泌物，伴有腹痛，一定要注意休息，动态的进行超声检查，了解宫内胚胎发育的情况。如果胚胎发育良好，可给予保胎治疗。如果胚胎发育异常，也避免盲目的保胎，要及时的阻止妊娠。女性孕早期一定要动态的进行超声检查，了解宫内胚胎发育的情况，如果有异常，要及时的给予治疗，避免胚胎停育时间较长，停育的胚胎在宫腔内，导致子宫内膜炎、宫腔黏连甚至继发性的不孕。