儿童支气管镜检查后副作用有鼻粘膜出血、继发感染等。具体如下：1、鼻黏膜出血，呼吸道黏膜出血、纵膈气肿等一些意外伤害，检查时有剧烈呕吐，可能会停诊检查失败，所以在检查前6小时内不能进食或饮水，并且要检查患者是否有意外伤害。2、继发感染，可能会出现咳嗽、喘息加重、发热、甚至出现喉痉挛、喉水肿、支气管痉挛等症状，导致呼吸困难、窒息等。3、呼吸困难，在检查中不配合，容易出现咽喉水肿和呼吸困难，低氧血症高反应性儿童，严重支气管痉挛引起低氧血症时，可能会危及儿童的生命。