中枢性呼吸暂停与阻塞性呼吸暂停主要的鉴别方法是临床表现不同，以及睡眠呼吸监测表现不同。 中枢性呼吸暂停与阻塞性呼吸暂停在临床表现上有所差异，前者出现呼吸暂停时同时伴随有胸腹部呼吸运动的消失，而后者出现呼吸暂停时胸腹部运动是存在的，只是鼻口气流显着下降或停止。 中枢性呼吸暂停与阻塞性呼吸暂停还可通过睡眠呼吸监测的方法进行鉴别，通过睡眠呼吸监测还可评估呼吸暂停的严重程度，以及缺氧的严重程度，指导进一步治疗。