噬血细胞综合征中医治疗原则为去邪扶正，一般用药连翘，金银花，蒲公英，淡豆豉，黄芩等清热解毒，茯苓，白术，薏米，麦芽，白扁豆等健脾祛湿和胃来进行调理治疗。噬血细胞紊乱造成的免疫系统破坏、免疫力低下应当属于中医所说的正气不足，易外感邪气的情况，通过中医扶正气应当可以有一定的辅助作用，起码可以改善病人身体情况，延长生存时间，等待合适配型的出现。中医将其归入伏邪的范畴，伏邪具有隐匿，积聚，动态等特点，邪气伏于里而不发于表，而发生多种病变及病理演变。