通常情况下，偶尔便秘灌肠不会产生明显的副作用，频繁而依赖性的便秘灌肠可出现肠黏膜受损、肠道菌群失调、肠壁敏感性降低等副作用。因此，不建议长期依靠灌肠缓解便秘，可通过运动、饮食缓解不良症状。1、肠黏膜受损：肠管壁较为脆弱，如果频繁灌肠，可造成肠壁损伤，严重时可能引起肠道炎症；2、肠道菌群失调：如果长期灌肠，可能导致肠道内菌群失调，可因此出现腹痛、腹泻等不良症状；3、肠壁敏感性降低：长期灌肠可能会降低肠壁敏感，导致便秘症状加重；4、其他：灌肠时如果灌肠液温度较低，容易刺激肠道，使肠道内平滑肌剧烈收缩，发生肠痉挛，此时可出现腹痛、面色苍白等不适症状。