儿童巨噬细胞活化综合征可以通过手术进行治疗。巨噬细胞综合征是慢性风湿性疾病的重要并发症，其临床表现为持续发热、淋巴结肿大和神经系统受累，骨髓细胞学检查显示分化良好的巨噬细胞吞噬血细胞，通常会根据不同的诱因选择抗感染和抗病毒治疗，并停止使用可疑药物。通常采用激素类药物和细胞毒性药物治疗，可以和大剂量丙种球蛋白和生物制剂联合使用，采用自体干细胞移植。针对触发MAS的不同诱因，进行抗感染和抗病毒治理，停用可疑药物。