阿米巴原虫脑膜炎早期症状有剧烈头痛、高热、喷射性呕吐等等。阿米巴脑膜炎是一种急性脑膜炎，具有致命性，患者体内几乎来不及引起保护性的细胞和体液免疫反应。继则出现全身性或局限性癫痫发作，并有明显的脑膜刺激症状，体温急剧升高，可达39～40℃，头痛加剧，尤以额痛最甚，同时伴以恶心及喷射性呕吐。由于嗅神经及嗅球有严重炎症，额叶、颞叶和小脑有选择性损害，可有嗅觉、味觉，甚至视觉障碍，运动失调，烦躁不安，嗜睡，可很快转入意识不清和深度昏迷。