大便细菌培养主要是检查细菌性痢疾、伤寒、副伤寒、霍乱、食物中毒等疾病。通过粪便细菌培养，主要是利用粪便的特殊性和具体的特点，在人体肠道内存在着大量的细菌，而大肠杆菌、变形杆菌、产气杆菌等都是寄生在肠道内的细菌，不会使正常的肠道患病。但是如果肠道发生病理生理变化时，可以导致某些疾病如霍乱杆菌、沙门氏菌是常见的肠道病菌，这些菌种具有不同的特性，因此在采集处理和培养方法上有其不同的表现形式，经过大便培养，可以发现此类细菌，选择合理的药物进行治疗。