氨基酸尿症可通过饮水疗法，控制饮食，口服青霉胺等方法治疗，具体如下：1、饮水疗法：多喝水，特别在夜间也要保证一定的饮水量，防止尿液浓缩析出胱氨酸结晶，24h水摄入量至少在4L以上，使尿胱氨酸浓度稀释，保持在250mg/L以下。2、控制饮食：低蛋氨酸饮食，可减少胱氨酸尿。3、口服青霉胺：青霉胺可与胱氨酸作用生成可溶性半胱氨酸-青霉胺二硫化合物从尿中排出，可减少约50%的尿中游离胱氨酸，有防止结石形成的作用。本药不仅有预防作用，还可溶解正在形成的结石。