马蹄肾可以通过做手术来治疗。马蹄肾手术不是大手术，马蹄肾是由于先天性发育畸形导致。马蹄肾患者如果肾脏没有积水，肾功能正常，不需要特殊治疗，定期复查肾脏即可。也有部分马蹄肾患者由于存在发育畸形，有可能出现肾积水或者伴有输尿管发育畸形，这种情况就需要手术治疗。这个手术一般可以通过微创进行，其手术的目的主要是解除积水，如果肾脏有囊肿，而且囊肿体积比较大，也可以通过手术将囊肿切除，由于该手术是微创进行，所以术后恢复相对较快。