慢性结膜炎无法自愈，疾病没有自限性，治疗上比较棘手。可以针对不同致病原因进行治疗，同时给予适当的抗生素滴眼液及眼药膏。如左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液、红霉素眼膏、氧氟沙星眼膏等。如果上述用药效果不好，可以经结膜刮片做细菌培养和药敏试验，根据结果调整用药。在日常生活中要多休息，营养均衡，积极锻炼身体，增强体质。如果有急性细菌性结膜炎，需要及时治疗，避免转为慢性。还要避免一些非感染性因素，如粉尘和化学烟雾刺激、眼部长期应用有刺激性的药物、强光、屈光不正、烟酒过度、睡眠不足等。