龟头上有疙瘩要针对病因对症治疗。龟头上有疙瘩可考虑与毛囊感染、龟头炎以及皮脂腺囊肿有关，具体的治疗如下：一、毛囊感染：包皮表面长疙瘩还见于包皮发生毛囊感染，病人发生毛囊炎引起的包皮疖肿时，可以局部涂抹碘伏治疗。二、龟头炎：病人发生龟头炎引起的龟头红疹、红斑时，会发现龟头表面有小疙瘩症状，病人出现上述症状时，通常伴有水疱、脓疱，还会伴有局部瘙痒、刺痛症状。病人可以局部使用3%的硼酸洗液局部清洗，同时局部涂抹达克宁软膏治疗。三、皮脂腺囊肿：可以局部使用抗生素治疗，皮脂腺囊肿较大时还可以行局部手术切除。