肾病综合征并发症的原因是：机体免疫力下降、血栓以及高度水肿。最常见的肾病综合征并发症有三种：感染、血栓以及急性肾损伤。引起感染最主要的原因是机体免疫力下降，由于肾病综合征治疗过程中，需要应用激素和免疫抑制剂，会导致机体的免疫功能减退，容易合并感染。其次，是血栓的形成，因为在肾病综合征早期，会出现血液黏稠度增加，容易出现下肢深静脉和肾静脉的血栓，需要应用低分子肝素抗凝治疗。而急性肾损伤是因为高度水肿，导致机体有效血容量减少，出现肾脏缺血，引起肾脏损伤。