肠系膜脂膜炎如果反复发作、迁延不愈，有可能会癌变。如果病变牵及肠壁而发生狭窄，无法矫正者或者位于回盲部的病变不能除外，恶性肿瘤的患者可以做手术治疗，并且在术中密切观察病情，做病理学检测，明确具体的病情。肠系膜脂膜炎通常情况下预后良好，本病也有一定自限性的趋势，经几个月或者数年的支持治疗后，大多数患者的病情可以得到完全的控制，肠系膜脂膜炎目前尚无特效药物可以根治，主要是包括对症支持治疗和原发病的积极治疗。