晚上两三点咳嗽比较严重的原因要考虑呼吸系统及消化系统疾病。比如常见的包括咳嗽变异型哮喘、变异性咳嗽、过敏性咳嗽，都会出现晚上两三点咳嗽加重，而且以干咳为主，可以咳少许的白色粘痰。这类病人可以通过检查胸部CT、肺功能或者是呼出去一氧化氮检测、过敏原检测等进一步明确。晚上咳嗽比较严重应该进一步排除一些其他的胃食管反流病引起的咳嗽，或者药物性咳嗽等。可以完善胃镜，或者是注意询问患者的病史，然后进行积极处理。