病情分析：

小便发黄，右边腰有时候疼可能是肾盂肾炎、输尿管结石、肾小球肾炎、肾结石、膀胱炎等原因引起的，患者需要根据病因对症治疗。

1、肾盂肾炎

肾盂肾炎是指病原微生物侵犯肾盂以及肾实质引起的疾病，可能会导致肾脏功能受到损伤，从而出现尿液发黄、腰部疼痛等不适症状。患者可在医生指导下服用阿莫西林胶囊、盐酸左氧氟沙星胶囊等药物进行治疗。

2、输尿管结石

输尿管结石是由于肾结石下降，排入输尿管所引起的，可能会导致输尿管堵塞，从而出现尿液发黄、右边腰部疼痛等症状。患者可以在医生指导下服用排石颗粒、尿石通丸等药物进行治疗。必要时，患者也可以遵医嘱通过体外冲击波碎石术等方式进行治疗。

3、肾小球肾炎

肾小球肾炎是指肾小球损伤并伴有炎症，可能会导致肾脏功能下降，从而出现尿液发黄、右边腰部疼痛等症状。患者可以在医生指导下服用氢片、片等药物进行治疗。必要时，患者也可以遵医嘱通过透析治疗的方式进行治疗。

4、肾结石

肾结石是由于晶体物质异常聚积在肾脏而引起的一种疾病，可能会导致肾脏功能受到损伤，从而出现尿液发黄、右边腰部疼痛等症状。患者可以在医生指导下服用双氯芬酸钠缓释片、吲哚美辛胶囊等药物进行治疗。必要时，患者也可以遵医嘱通过体外冲击波碎石术等方式进行治疗。

5、膀胱炎

膀胱炎是指细菌感染引起的炎症性疾病，可能会导致膀胱黏膜充血、水肿，从而出现尿液发黄、右边腰部疼痛等症状。患者可以在医生指导下服用盐酸左氧氟沙星胶囊、头孢呋辛酯片等药物进行治疗。

建议患者及时就医，明确具体病因后进行对症治疗。