病情分析：上午打疫苗下午咳嗽可以吃药，但需在医生指导下进行，以避免与疫苗接种后的反应产生相互作用。
由于咳嗽可能是多种原因引起的，如感冒、过敏等，因此在服用药物前应咨询医生，以确定咳嗽的原因并选择合适的药物治疗。同时，应注意观察咳嗽症状的变化，如有加重或伴随其他症状，应及时就医。