病情分析：

阴茎短小只有两厘米勃起才有5厘米，属于正常情况。但需要考虑存在发育迟缓、包皮过长、隐匿阴茎、激素水平下降等异常情况。

1、发育迟缓

如果患者在儿童时期发育迟缓，可能会导致阴茎发育受到限制，出现阴茎短小只有两厘米的情况。一般属于正常现象，不需要特殊治疗，患者在日常生活中可以适当进食富含蛋白质、维生素等营养物质的食物，如鸡蛋、芹菜等，有助于促进发育。

2、包皮过长

如果患者存在包皮过长的情况，可能会导致包皮完全覆盖阴茎头及尿道外口，从而导致阴茎显得比较短小，出现只有两厘米的现象。如果患者没有其他不适症状，一般不需要进行特殊治疗，但如果患者出现不适症状，则可以通过包皮环切术进行治疗。

3、隐匿阴茎

隐匿阴茎是一种常见的先天性疾病，可能与肥胖、耻骨前脂肪堆积等因素有关，临床上一般会表现为阴茎显得比较短小，患者还可能会出现排尿困难、勃起功能障碍等症状。建议患者可以在医生指导下通过阴茎背神经阻断术、阴茎假体植入术等方式进行治疗。

4、激素水平下降

如果患者存在长期熬夜、精神压力过大等情况，可能会导致体内激素水平下降，从而出现阴茎短小的情况。建议患者可以适当进行体育锻炼，如慢跑、游泳等，有助于排解压力，保持良好的心态。必要时，患者可以及时就医，在医生指导下使用十一酸睾酮胶丸、复方八维胶囊等药物进行治疗。

5、前列腺炎

前列腺炎通常是指前列腺出现了炎症反应，一般与细菌感染、长期喝酒等因素有关，患者可能会出现尿频、尿急、阴茎变小等症状，还可能会出现上述症状。建议患者可以在医生指导下使用盐酸坦索罗辛缓释胶囊、头孢克肟胶囊等药物进行治疗。

除此之外，建议患者及时去医院就医，明确疾病对症治疗，以免延误病情。