病情分析：肺炎衣原体感染不是甲流。
肺炎衣原体感染是衣原体感染，而甲流是由甲型流感病毒感染引起的，二者病原体不同，因此不是同一种疾病。
除了上述两种疾病外，患者还可能患有支原体、细菌性咽扁桃体炎等呼吸道感染性疾病。这些疾病都可能导致咳嗽、发热等症状，需要通过实验室检测来区分。
在诊断肺炎衣原体感染时，应考虑是否存在与之相关的症状，并建议进行相应的实验室检测以确认诊断。