病情分析：龟头流脓小便刺痛可能是淋球菌性尿道炎、非淋菌性尿道炎、龟头炎、前列腺炎、膀胱炎等疾病的表现，这些疾病都与泌尿系统感染有关。患者应及时就医进行相关检查，以便明确诊断并接受适当治疗。
1.淋球菌性尿道炎
淋病奈瑟菌感染导致黏膜损伤和炎症反应，引起尿道口红肿、排尿困难等症状。患者可在医生指导下使用头孢曲松钠、大观霉素等抗生素进行治疗。
2.非淋菌性尿道炎
由沙眼衣原体、解脲支原体等致病微生物引起的尿道炎，典型表现为尿道瘙痒、烧灼感以及分泌物增多。当病变累及尿道时，可出现尿频、尿急、尿痛的症状。患者可以遵医嘱服用阿奇霉素或多西环素等药物进行治疗。
3.龟头炎
龟头炎通常是由细菌或真菌感染引起的局部炎症，会导致龟头部疼痛、红斑、水肿等症状，严重时会引起龟头部位化脓，从而诱发小便刺痛的情况发生。患者可以在医生指导下外用克霉唑乳膏、硝酸咪康唑乳膏等抗真菌药膏进行治疗。
4.前列腺炎
由于病原体感染、盆腔积液等原因导致的前列腺组织炎症，炎症因子刺激局部组织，进而引发尿频、尿急、尿痛、尿后滴白、下腹坠胀、肛门不适、阴部痛痒等不适症状。患者需要遵照医生的意见口服塞来昔布胶囊、盐酸坦索罗辛缓释胶囊等止痛药物缓解不适症状。
5.膀胱炎
膀胱受到细菌入侵而产生炎症，此时会对膀胱造成一定的刺激，使患者出现尿频、尿急、尿痛、尿道烧灼感等症状，还可能会伴有血尿的现象。患者应就医通过静脉注射等方式给予左氧氟沙星注射液、盐酸莫西沙星氯化钠注射液等药物控制感染。
针对龟头流脓伴随小便刺痛的情况，建议及时就医并进行相关检查如尿常规、尿培养以确定致病菌种类。同时，保持个人卫生，避免过度清洗以防破坏正常菌群平衡，还要多喝水促进排泄，有利于病情恢复。