病情分析：三岁小孩指甲变厚、脚痛可能与甲癣或足癣有关，通常可通过抗真菌治疗、对症止痛治疗、中药外用治疗来缓解症状。
1.抗真菌治疗
针对指甲变厚和脚痛，可以使用含有抗真菌成分的药物进行治疗。如特比萘芬乳膏、酮康唑洗剂等，这些药物能够有效地抑制真菌生长，缓解症状。
2.对症止痛治疗
对于脚痛的症状，可以给予非甾体类抗炎药如布洛芬、对乙酰氨基酚等进行止痛。这些药物能够减轻炎症反应和缓解疼痛。
3.中药外用治疗
中医认为指甲变厚和脚痛可能与体内湿热有关，可以使用具有清热解毒、祛湿作用的中药外敷或浸泡。如金银花、连翘等具有清热解毒作用的中药，以及白芷、防风等祛湿药。
在处理三岁小孩指甲变厚和脚痛时，应避免自行使用未经医生指导的药物或治疗方法。同时要注意保持良好的个人卫生习惯，勤换鞋袜，并确保孩子的饮食均衡营养，以增强免疫力。