病情分析：钙化性肌腱炎术后40天仍然存在轻微的疼痛可能是正常的恢复过程，但若疼痛严重或持续时间较长，则可能需要进一步检查和治疗。
钙化性肌腱炎术后40天仍然疼痛可能与手术后恢复、炎症反应、肌腱修复等因素有关。手术后40天疼痛可能表明炎症反应尚未完全消退，或者肌腱修复过程中的不适感。如果疼痛程度较轻，且没有其他异常症状，可能是正常的恢复过程。但如果疼痛剧烈或持续时间较长，可能需要进一步检查以排除其他并发症。
建议患者继续遵循医生的康复指导，避免剧烈运动和重负荷活动，同时注意休息和适当的物理治疗。