病情分析：蛋白S低可能由基因缺陷引起。
蛋白S是一种抗凝血因子，其水平低下可能导致血栓形成的风险增加。基因突变或缺陷可能导致蛋白S的合成或功能异常，从而导致蛋白S水平降低。因此，蛋白S低可能是由基因缺陷引起的，需要进一步的基因检测来确定具体原因。