病情分析：男性尿道疼痛小便刺痛，晚上睡觉醒来尿又不痛可能是急性的泌尿系统感染导致的。一般，患者还会出现尿频、尿急、尿痛以及发热、寒战等症状。抗生素可用于治疗，如头孢拉定、头孢氨苄、头孢唑林、头孢呋辛以及头孢西丁等。患者应保持清洁，多喝水，多小便。如果药物治疗无效，需要到医院进行检查治疗。